杨琛
个人简介
1990-1997 浙江大学化学工程系 学士、硕士
1997-2001 日本九州工业大学生物科学和生物信息学系 博士
2001-2004 日本庆应大学 博士后
2004-2008 美国Burnham医学研究所 博士后
2008至今 中科院上海生科院植物生理生态研究所 研究员
研究工作
课题组致力于定量理解与人工调控细胞代谢网络的运行。主要研究兴趣包括:1)开发代谢流量分析与代谢组分析技术;2)研究重要模式及工业微生物代谢网络调控的分子机制,揭示各种调节机制对代谢流量的调控机理,为合理改造细胞代谢、优化微生物生产提供理论依据;3)开展光合微生物的代谢工程与合成生物学研究,建立萜类化合物的光合自养细胞工厂。
主要成果
1)发展了动态代谢流量分析技术,建立了代谢流量组与代谢组分析技术平台;
2)揭示了丙酮丁醇梭菌和蓝细菌碳氮代谢的多个重要调控机制,为木质纤维素丁醇制造以及构建光合自养细胞工厂提供了理论基础;
3)改造蓝细菌、实现了异戊二烯的高效异源合成,达到目前萜类化合物光合生产的最高产量和产率。
1.Xiang Gao, Fang Gao, Deng Liu, Hao Zhang, Xiaoqun Nie, Chen Yang* (2016) Engineering the methylerythritol phosphate pathway in cyanobacteria for photosynthetic isoprene production from CO2. Energy and Environmental Science 9: 1400-1411.
2.Xiaoqun Nie#, Bin Yang#, Lei Zhang, Yang Gu, Sheng Yang, Weihong Jiang, Chen Yang* (2016) PTS regulation domain-containing transcriptional activator CelR and sigma factor σ54 control cellobiose utilization in Clostridium acetobutylicum. Molecular Microbiology 100: 289-302.
3.Deng Liu and Chen Yang* (2014) The nitrogen-regulated response regulator NrrA controls cyanophycin synthesis and glycogen catabolism in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. Journal of Biological Chemistry 289: 2055-2071.
4.Lei Zhang, Xiaoqun Nie, Dmitry Ravcheev, Dmitry Rodionov, Jia Sheng, Yang Gu, Sheng Yang, Weihong Jiang, Chen Yang* (2014) Redox-responsive repressor Rex modulates alcohol production and oxidative stress tolerance in Clostridium acetobutylicum. Journal of Bacteriology 196(22): 3949-3963.
5.Lixia Liu#, Lei Zhang#, Wei Tang, Yang Gu, Qiang Hua, Sheng Yang, Weihong Jiang, Chen Yang* (2012) Phosphoketolase pathway for xylose catabolism in Clostridium acetobutylicum revealed by 13C metabolic flux analysis. Journal of Bacteriology 194(19): 5413-5422.