用于鉴定水稻粒型的SNP分子标记

一、项目简介

本发明属于植物基因组学与分子育种技术领域,具体涉及一种用于鉴定水稻粒型的SNP(单核苷酸多态性)分子标记的开发及其应用。水稻粒型(包括粒长、粒宽等)是直接影响产量和外观品质的重要性状。

本发明针对传统水稻粒型鉴定依赖田间表型观察、周期长、效率低且易受环境影响的瓶颈,开发了一种与水稻粒型基因紧密连锁的SNP分子标记——KASP_GLW7。该标记位于水稻基因组中的一个特定SNP位点(例如序列表中SEQ ID No.4的第101位核苷酸,其核苷酸种类为C或G),该位点的基因型与水稻粒长显著相关。通过先进的竞争性等位基因特异性PCR(KASP)技术,可对水稻材料在该位点的基因型进行快速、高通量的分型鉴定。该方法无需进行繁琐的酶切、凝胶电泳或测序步骤,减少了气溶胶污染和有毒试剂(如溴化乙锭)的使用,更环保安全。应用本标记可在水稻育种早期对幼苗进行DNA水平筛选,显著减小田间试验规模,降低育种成本,加速优质长粒或短粒水稻新品种的选育进程。

二、专利摘要

本发明公开了一种水稻粒型的SNP分子标记记SEQ ID NO:1及其用于鉴定水稻粒型的用途。该SNP分子标记SEQ ID NO:1能够能够用于在水稻幼苗期预先判断水稻粒型大小,准确度高,有助于提高育种效率,实现了小粒品种改良,具有推广应用价值。

三、专利状态

本技术已递交中国专利申请,申请号:202410551072.9,实质审查中;持有人项目编号:SIPPE24-28。

四、持有单位

中国科学院分子植物科学卓越创新中心。

五、合作方式

转让、许可或合作研发。

六、联系方式

张雯,wzhang@cemps.ac.cn,021-54924138。