在植物中可视化检测转座子的方法

一、项目简介

本发明属于植物分子生物学与基因组学领域,具体涉及一种名为SAKE(在植物中可视化检测转座子的方法)的创新技术。转座子,也称为“跳跃基因”,是基因组中能够改变自身位置的一段DNA序列,对植物基因组的进化、遗传多样性产生及作物驯化具有重要作用。然而,由于技术限制,在体细胞水平直接观察转座子的活动一直非常困难。

SAKE方法的核心在于构建一种巧妙的报告系统。该报告系统包含一个经过改造的转座子序列,该序列中整合了一个报告基因表达盒(例如使用荧光素酶等报告基因)。这个报告基因的表达被精心设计为依赖于转座事件的成功发生。具体而言,当转座子被激活并从原始基因组位置“跳跃”并整合到新位置时,其携带的报告基因才会被激活表达,从而产生可检测的信号(如荧光)。通过检测这种信号,研究人员可以直接在植物组织(如叶片、根尖等)中可视化地观察到转座子发生活动的具体位置,并能对转座活动的频率进行定量分析。

该方法特别适用于研究长末端重复逆转录转座子,这是植物中最主要的转座子类型之一。SAKE技术为在体细胞水平实时、原位研究转座子的活性、移动性及其对逆境胁迫(如高温、损伤等)的响应提供了强大工具,对功能基因组学研究和作物遗传改良具有重要价值。二、专利摘要

本发明提供了一种在植物中可视化检测转座子的方法(SAKE),并将其应用于转座子活性、移动性的检测。SAKE是一种检测体细胞逆转录转座的可靠方法,对于定位转座发生的位置和定量测量转座活动特别有用。

三、专利状态

本技术已递交中国专利申请,申请号:202310438762.9,实质审查中;持有人项目编号:SIPPE23-02。

四、持有单位

中国科学院分子植物科学卓越创新中心。

五、合作方式

转让、许可或合作研发。

六、联系方式

张雯,wzhang@cemps.ac.cn,021-54924138。