基于高通量全基因组测序的多亲本作物基因型鉴定
一、项目简介
本发明属涉及生物信息处理技术领域。本发明的目的是提供一种分析快速、结果准确的对多亲本植物基因型进行鉴定的方法及装置,从而可以快速准确可靠地分析多亲本构建的群体基因型,实现更有效的遗传作图和基因组分析。
二、专利摘要
本发明提供了基于高通量全基因组测序的多亲本作物基因型鉴定。具体地,包括:(a)对于n个亲本及其子代,提供待鉴定的子代作物的测序数据Df,以及与所述子代作物相应的亲本作物的测序数据Dp,其中n为≥3的正整数;(b)基于所述测序数据Df和所述测序数据Dp,确定亲代和子代的SNP位点信息;(c)基于所述的SNP位点信息,对子代的基因型进行判断,从而获得所述子代的各个SNP的评定结果以及所述子代的全基因组的各染色体上的重组断裂点的分布信息;(d)构建和/或绘制所述子代的基因型图谱,从而获得所述多亲本作物的基因型鉴定结果。本发明的方法可高通量、快速、准确的对多亲本作物基因型进行鉴定。
三、专利状态
本技术已递交中国专利申请,申请号:202110131330.4,实质审查中;持有人项目编号:SIPPE20-60。
四、持有单位
中国科学院分子植物科学卓越创新中心。
五、合作方式
转让、许可或合作研发。
六、联系方式
张雯,wzhang@cemps.ac.cn,021-54924138。